NMR SPEKTROSZKÓPIAI LABOR

Kutatásaink

1) Általánosan alkalmazható módszerek (NMR, SAXS, CD ötvözete) kidolgozása, melyek a komplex membrán folyamatok megértését és leírását segítik.

2) Az új, általunk fejlesztett NMR spektroszkópiai módszerek az IDPk fiziológiás körülmények melletti jellemzését szolgálják. NMR-MD technikák ötvözetével írjuk le a nem triviális „fuzzy” komplexek szerkezetét, dinamikáját.

Céljaink

  • Globális paraméterek meghatározásán alapuló NMR-SAXS technikák ötvözetével eldönthető legyen a membrán és a peptid, vagy a hatóanyag jelölt molekula kölcsönhatásának jellege. A peptid szerkezeti változásának vizsgálata.
  • Hα-detektáláson alapuló NMR mérési módszerek fejlesztése fehérjék fiziológiás körülmények melletti vizsgálatához.
  • Tumorszupresszor p53TAD(1-60) szakaszának a tumormarker S100A4-el történő kölcsönhatásának leírása
  • EZH2 fehérje és RNS kölcsönhatása

Hol tartunk jelenleg?

  • Kidolgoztunk egy NMR-SAXS módszert DHPC bicella – peptid rendszerek méret- és alakmeghatározására.
  • Jellemeztük egy antifungális peptid és tartrazin ételfesték kölcsönhatását.
  • NMR-MD technikával megadtuk a p53TAD(1-60) és Ca2+ kötött S100A4 fehérje komplex szerkezeti modelljét, és leírtuk ezen “bolyhos” (fuzzy) komplex oldatbeli mozgásait.
  • Bevezettük az új SHACA, szelektív homonukleáris lecsatoláson alapuló 2D NMR pulzus szekvenciát és alkalmazhatóságát bizonyítottuk különféle fehérjéken

SZOLGÁLTATÁSAINK

Kismolekulák szerkezeti, tisztasági vizsgálata 1D, 2D multinukleáris NMR módszerekkel


PARTNEREINK ÉS REFERENCIÁINK

  • ELTE, Biokémiai Tanszék: Nyitray László kutatócsoportja
  • Debreceni Egyetem: Bányai István és Kövér Katalin kutatócsoportjai
  • KIT, Karlsruhe Institute of Technology, Németország: Burkhard Luy kutatócsoportja
  • Medi-Radiopharma Kft.
  • TTK Természettumányi Kutatóközpont: Beke Tamás, Bóta Attila, Tantos Ágnes kutatócsoportjai
  • Szegedi Tudományegyetem: Tóth Gábor kutatócsoportja
  • Bruker Biospin, Rheinstetten, Németország: Wolfgang Bermel CNRS/CEA/ University of Paris Saclay, Franciaország: Francois-Xavier Theillet kutatócsoportja

CSAPATUNK

Bodor Andrea
a kutatócsoport vezetője
ELTE

Sebák Fanni
ELTE

Szabó Csenge Lilla
ELTE
Kovács Dániel
ELTE

Bodor Andrea előadása a Szakmai Napon 2020.11.11.