NMR SPEKTROSZKÓPIAI LABOR
Kutatásaink
1) Általánosan alkalmazható módszerek (NMR, SAXS, CD ötvözete) kidolgozása, melyek a komplex membrán folyamatok megértését és leírását segítik.
2) Az új, általunk fejlesztett NMR spektroszkópiai módszerek az IDPk fiziológiás körülmények melletti jellemzését szolgálják. NMR-MD technikák ötvözetével írjuk le a nem triviális „fuzzy” komplexek szerkezetét, dinamikáját.
Céljaink
- Globális paraméterek meghatározásán alapuló NMR-SAXS technikák ötvözetével eldönthető legyen a membrán és a peptid, vagy a hatóanyag jelölt molekula kölcsönhatásának jellege. A peptid szerkezeti változásának vizsgálata.
- Hα-detektáláson alapuló NMR mérési módszerek fejlesztése fehérjék fiziológiás körülmények melletti vizsgálatához.
- Tumorszupresszor p53TAD(1-60) szakaszának a tumormarker S100A4-el történő kölcsönhatásának leírása
- EZH2 fehérje és RNS kölcsönhatása
Hol tartunk jelenleg?
- Kidolgoztunk egy NMR-SAXS módszert DHPC bicella – peptid rendszerek méret- és alakmeghatározására.
- Jellemeztük egy antifungális peptid és tartrazin ételfesték kölcsönhatását.
- NMR-MD technikával megadtuk a p53TAD(1-60) és Ca2+ kötött S100A4 fehérje komplex szerkezeti modelljét, és leírtuk ezen “bolyhos” (fuzzy) komplex oldatbeli mozgásait.
- Bevezettük az új SHACA, szelektív homonukleáris lecsatoláson alapuló 2D NMR pulzus szekvenciát és alkalmazhatóságát bizonyítottuk különféle fehérjéken
SZOLGÁLTATÁSAINK
Kismolekulák szerkezeti, tisztasági vizsgálata 1D, 2D multinukleáris NMR módszerekkel
PARTNEREINK ÉS REFERENCIÁINK
- ELTE, Biokémiai Tanszék: Nyitray László kutatócsoportja
- Debreceni Egyetem: Bányai István és Kövér Katalin kutatócsoportjai
- KIT, Karlsruhe Institute of Technology, Németország: Burkhard Luy kutatócsoportja
- Medi-Radiopharma Kft.
- TTK Természettumányi Kutatóközpont: Beke Tamás, Bóta Attila, Tantos Ágnes kutatócsoportjai
- Szegedi Tudományegyetem: Tóth Gábor kutatócsoportja
- Bruker Biospin, Rheinstetten, Németország: Wolfgang Bermel CNRS/CEA/ University of Paris Saclay, Franciaország: Francois-Xavier Theillet kutatócsoportja